《公示》中表示，东南大学是中央直管、教育部直属、“双一流”建设A类高校。为服务国家重大战略，服务社会重大关切，服务产业重大需求，南通市与东南大学拟于江苏南通创新区规划建设东南大学南通校区。
建设东南大学南通校区是积极策应国家厚植学科基础、培育新兴交叉学科生长点战略布局的重要举措，有助于校地整体统筹海洋等领域科学研究和人才培养，推动校地融合发展提质升级。
校区将围绕国家重大战略需求和产业前沿，加快建设面向未来的学科体系，服务经济高质量发展，为科技强国、教育强国提供人才支撑和智力保障。
据此前报道，2023年12月24日，东南大学与南通签署战略合作框架协议。在长三角一体化重要战略背景下，南通具有独特的区位优势和发展机遇，东大正以海洋为切口推动学科版图优化升级。协议强调携手推动办学资质报批、中外合作办学、政策资金争取等重点事项落地；要以高品质校区、高品质师资推动产出高品质成果。期间还实地考察了紫琅科技城、五山及滨江片区、花鸟园片区等处。
2024年4月15日，南通市人民政府办公室发布《关于印发2024年市本级政府投资社会事业及业务用房项目计划的通知》，东南大学南通校区（筹）项目已纳入2024年市本级政府投资社会事业及业务用房前期项目。
2024年11月21日，南通市人民政府印发《关于深入推进海洋经济高质量发展的若干措施》，文件提到：放大省船舶与海洋工程装备技术创新中心、南通海洋高等研究院等平台示范效应，规划建设东南大学国际海洋学院（南通校区）。